La protection de l’environnement constitue une haute priorité. En effet, l’un des lacs de la municipalité, le lac Nairne, a commencé à montrer des signes d’eutrophisation en 2002. Au mois d’août, on a assisté à une mortalité massive d’ombles de fontaine (Salvelinus fontinalis) et d’ombles chevalier dulcicole. Diverses analyses ont permis d’identifier des causes environnementales à cette mortalité massive. En effet, la température élevée des eaux de surface jumelée à l’absence d’oxygène en profondeur ont eu comme conséquence la migration des ombles, à la recherche d’eaux plus froides et mieux oxygénées, vers les tributaires du lac. Cette concentration de poissons leur a été néfaste. Les pertes ont été très élevées de telle sorte que le ministère du Développement durable, de l’environnement et de la faune a interdit la pêche en période hivernale en raison de la présence de l’omble chevalier, espèce particulièrement sensible à la pêche à cette période.
L’eutrophisation du lac Nairne a été confirmée peu de temps après la mortalité de poissons du mois d’août. Le mois suivant, en septembre, le lac connaissait sa première floraison d’eau. Les algues bleu-vert, ou cyanobactéries, et la mortalité de poissons ont suscité une prise de conscience chez les riverains du lac Nairne et les résidents de la municipalité de quant à l’urgence de préserver les ressources notamment lacustres de Saint-Aimé-des-Lacs.
Afin de contrer l’eutrophisation du lac Nairne et d’en redonner les usages11 Il convient de noter que suite à la mortalité de poissons et aux fleurs d’eaux de septembre 2002, la Régie régionale de la santé et des services sociaux a émis, dès le 23 août, des avis de non-consommation et de non-utilisation des eaux du lac. En outre Faune et Parcs a interdit, le 3 décembre 2002, la pêche hivernale au lac Nairne. à la population, l’Association pour la protection du lac Nairne inc a présenté, le 7 août 2002, à ses membres rassemblés en assemblée générale annuelle, ses propositions d’interventions. Ce plan a été déposé le 4 septembre 2002 au Conseil muncicipal de Saint-Aimé-des-Lacs. Il propose :